sábado, 24 de noviembre de 2018

Ejemplo de ADN recombinante: en la naturaleza y uno artificial en neumonía por Streptococcus pneumoniae

1. Ejemplo de ADN recombinante en la naturaleza
La transferencia horizontal de genes, es una forma de recombinación homóloga de las bacterias, consiste en tomar ADN del exterior e incorporarlo a su material genético. Por otro lado, este acontecimiento ocurre en el hábitat natural de Streptococcus pneumoniae, la nasofarínge. En poblaciones mixtas de Streptococcus pneumoniae cuyo crecimiento se produce en la superficie epitelial suelen formar un biofilm, estas biopelículas contienen grandes cantidades de ADN de tal manera que podrían competir con cualquier ADN liberado durante los ataques de tipo fratricida. 
Se ha demostrado altos índices de transferencia de genes en lo que respecta a las biopelículas neumocócicas. 

Competencia para la transformación genética natural en S. pneumoniae, El principal interruptor regulador consiste en cinco proteínas (ComABCDE) que juntas conforman un sistema.


2. Ejemplo de ADN recombinante artificial

Para que Streptococcus pneumoniae sobreviva es necesario que se adapte a las intervenciones clínicas, es por ello que la variación genómica es un mecanismo fundamental para la adaptación al entorno del huésped. El estrés producido por los antibióticos induce a la competencia en el neumococo, es decir durante la fase de competencia Streptococcus pneumoniae adquiere ADN exógeno de esta forma incluye genes que confieren resistencia a los antibióticos, los reemplazos de recombinación se encuentran en los genes de las proteínas de unión a la penicilina (PBP). Por otro lado al mutarse los genes PBP se presenta resistencia a los β-lactámicos: amoxicilina, penicilina y cefotaxima.





Referencias:

sábado, 17 de noviembre de 2018

Prueba molecular microarray para el patógeno respiratorio Streptococcus pneumoniae


La diversidad en los patrones de antígenos neumocócicos ha permitido la realización de un microarray de proteoma constituido por aproximadamente 2,000 proteínas pertenecientes al neumococo, además de los 208 anticuerpos fuertemente vinculados a seres humanos adultos. Resulta fundamental la caracterización de la respuesta inmune frente a las proteínas neumocócicas para entender los aspectos epidemiológicos y de vacunación, es por ello que la prueba de microarray de proteoma ha revelado la gran afinidad que presenta la inmunoglobulina IgA por los antígenos potenciales (alrededor de 2,190) de  Streptococcus pneumoniae.


Referencias:

domingo, 11 de noviembre de 2018

Prueba de Reacción en cadena de polimerasa en neumonía por Streptococcus pneumoniae

T: Detección de ADN neumocócico en sangre mediante la reacción en cadena de polimerasa
O: Investigar el rendimiento de la PCR en muestras de sangre para el diagnóstico de neumonía neumocócica en niños.
M: sangre; extracción: usando el mini kit QIAamp DNA blood 
AN: ADN genómico
G: gen de la autolisina lyt A: 927 pb
PCR: PCR cuantitativa en tiempo real
V: no especifica
SA: > 6.9 log 10 copias / mL 
EA: 88% a 99% 



Asociación entre la carga de la reacción en cadena de la polimerasa neumocócica (PCR) (log 10copias / ml) en muestras nasofaríngeas / orofaríngeas (NP / OP) y de sangre total (WB)



Referencias: 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5447841/

viernes, 2 de noviembre de 2018

Prueba de tamizaje y confirmatoria para neumonía por Streptococcus pneumoniae

Prueba de tamizaje: Radiografía del tórax (CXR)
En el manejo clínico corresponde una herramienta fundamental para el diagnóstico de neumonía en la población infantil, la organización mundial de la salud estableció una metodología optima, consiste en realizar la toma de la imagen en formato antero-posterior o postero-anterior. Por otra parte, para la interpretación estandarizada de CXR, en lo que respecta a los resultados se toma como referencia: la consolidación (opacidad densa que ocupa parte del pulmón, otro infiltrado (densidades lineales, con engrosamiento peribronquial), derrame pleural (presencia de líquido en el espacio pleural), imprimible (se refiere a características de la imagen que no son interpretables). 


Prueba confirmatoria: Reacción de Quellung o prueba de Neufeld
Es un método para la confirmación y el serotipo de Streptococcus pneumoniae, consiste en probar la suspensión de células de neumococo mediante la utilización de una pequeña cantidad de antisueros combinados y específicos dirigidos en contra del polisacárido capsular. La visualización de las reacciones antígeno-anticuerpo se realiza microscópicamente con un aumento de 400x. Este protocolo consta de tres pasos:
1. En la preparación se realiza la suspensión de células bacterianas
2. En un portaobjetos de vidrio se mezcla las células junto con el antisuero
3. Con ayuda de un microscopio se realiza la lectura de la reacción de Quellung

Reacción de Quellung negativa y positiva. Las preparaciones de aislado de neumococo serotipo 9V sin antisuero ( 1A ) y con antisuero del grupo 9 ( 1B ), se observaron con un aumento de 400X. Este último muestra la "hinchazón" y el redondeo de las células bacterianas que se ven típicamente en una reacción de Quellung positiva


Referencias: